Le système concerné est désactivé, un ou plusieurs ingénieurs doivent vérifier la totalité du système en le démontant et vérifiant chaque pièce. Cela prends généralement des heures. Le chef de département concerné ou le chef ingénieur doit donner un ordre direct pour que l'on effectue ce type d'analyse. L'officier commandant est automatiquement informé de cet état de fait et de l'indisponibilité du système. Un rapport complet sera envoyé au chef ingénieur et au chef de département une fois le travail terminé, avec copie au premier officier. Ce type d'analyse n'est utilisé que lorsqu' un système est gravement avarié ou qu'il y a un risque majeur pour la sécurité de l équipage.

Le chef de quart de l'ingénierie ou du département opération doit donner un ordre direct pour qu'on procède à ce niveau d'analyse technique. Un ingénieur ou un officier d'opération ouvre la console ou le système concerné. Le système reste normalement branché et opérationnel si cela est possible et ne présente pas de danger pour le personnel, l'officier contrôle l'opérationnalité de chaque sous système à l'aide de ses instruments. Cela prend généralement entre 15 minutes et une heure, selon le système. Le chef de département en charge du matériel en question et le chef ingénieur doivent recevoir un rapport complet si l'on procède à ce diagnostic. On effectue ce type de diagnostic qu'en cas d'avarie grave ou lors d'une révision technique complète du navire.

Analyse semi-automatisé ordonnée directement par un ingénieur ou un officier d'opération qui supervise le travail de l'ordinateur. Le système fournit lui même un rapport d'analyse au bout de dix minutes et signale toute anomalies constatées. Un officier peut superviser plusieurs systèmes effectuant ce niveau d'analyse en même temps. Cela prend en moyenne entre 5 et 10 minutes. Le système vérifie opérationnalité de chacun de ses composants et suggère le remplacement de ceux qui ne correspondent plus aux paramètres optimaux, même s'ils sont toujours opérationnels.

Analyse automatisée programmée sur base régulière par les ingénieurs ou officiers d'opérations, généralement au début de chaque quart. Un rapport est fourni au bout de trente secondes en moyenne, aucune vérification de l'équipage n'est nécessaire, mais si une anomalie est constaté l'ordinateur prévient le responsable du poste concerné, le chef de quart du département concerné ainsi que le chef de quart en ingénierie.

L'ordinateur effectue ce diagnostic seul sur base régulière, son but est d'être rapide et de ne consommer qu'un minimum de ressources, ce qui implique que cela est moins précis. Le rapport est fournit en 2.5 secondes en moyenne. En cas de problème détecté l'ordinateur entame automatiquement un diagnostic de niveau 4 et envoie une note au responsable du poste concerné.

Tous les systèmes non primordiaux sont soumis au diagnostique de niveau 5 toutes les heures ou à la moindre activité inhabituelle. Les systèmes importants sont soumis à un diagnostique de niveau 4 toutes les heures et un niveau de 3 au début de chaque quart. ( ex : système de survie ).

En cas de passage en Alerte Jaune un diagnostique de niveau 4 est immédiatement effectué sur tous les systèmes vitaux ainsi que sur les communications, boucliers et armements. Un diagnostic de niveau 5 est automatiquement effectué toutes les 4 minutes sur l'ensemble des systèmes sus nommés.

En cas d'Alerte Rouge un diagnostique de niveau 4 est immédiatement effectué sur tous les systèmes vitaux ainsi que sur les communications, boucliers et armements. L'ordinateur effectue des diagnostics de niveau 5 en permanence sur tous le systèmes actifs afin de donner à l équipage des informations en temps réel.